Nakon Domovinskog rata i mirne reintegracije Baranje u Republiku Hrvatsku konačno je 23. listopada 2000. godine započela obnova OŠ "Beli Manastir".
Zbog predviđenih radova na školi i školska godina 2000./01. isla je drukčijim tijekom, te je nastava od travnja organizirana u šestodnevnom radnom tjednu i tijekom proljetnih praznika i završila ranije, 15. svibnja.
Obnovu je financiralo Ministarvstvo prosvjete i športa pod pokroviteljstvom pročelnice Ureda za prosvjetu, šport, kulturu i tehničku kulturu Ksenije Zbožil.
Obnova je završena do početka školske godine 2001./02., a svečano otvorenje školske zgrade bilo je 21. rujna 2002. godine.
"Iskreno sam sretan što smo danas predali na uporabu obnovljenu školsku zgradu. Velik je to dobitak i velika nada za školstvo Belog Manastira. Tako smo omogućili kvalitetnije uvjete rada. Zahvaljujem se svim poštovanim kolegicama i kolegama i svim zaposlenima na uloženim naporima. Dragim učenicama i učenicima želim mnogo uspjeha, sreće i osmijeha" - rekao je tadašnji ministar Prosvjete i športa dr. sc. Vladimir Strugar i pritiskom na zvono otvorio obnovljenu školu.
Na otvaranju škole bili su brojni gosti, iz Ministarstva prosvjete i športa, grada Belog Manastira, drugih škola, te brojni nastavnici, učenici, roditelji. Uz prigodan program i ugodno i veselo ozračje, otvorena je obnovljena škola.